PIK3CA
PALB2
CHEK2
ATM
BRCA2
BRCA1
набор реагентов для целевого обогащения и приготовления библиотек ДНК с последующим одновременным выявлением генетических вариантов в генах
HELICON® АВС Плюс
Совместим с MGI
+ PALB2
+ CHEK2
+ ATM
BRCA2
BRCA1
+ PALB2
BRCA2
BRCA1
+ PIK3CA
BRCA2
BRCA1
Генетические маркеры в составе HELICON® АВС Плюс
Опухолевое заболевание и соответствующие Клинические рекомендации МЗ РФ
Возможность одновременного исследования дополнительных клинически востребованных маркеров
2
Определение полных кодирующих последовательностей генов BRCA1 и BRCA2
1
Всё, что нужно, в одной тест-системе
Минимальное рекомендуемое покрытие для всех типов биоматериала
5000x
Набор предназначен для совместного использования с секвенатором генетическим HELICON® G50/G400 (Wuhan MGI Tech Co., Ltd).
Параметры секвенирования
G400 SM FCL PE150
G400 SM FCL PE100
Набор реагентов MGI G400 для высокопроизводительного секвенирования, в вариантах исполнения:
G50 SM FCS PE150
G50 SM FCS PE100
G50 SM FCL PE150
G50 SM FCL PE100
Набор реагентов MGI G50 для высокопроизводительного секвенирования, в вариантах исполнения:
В зависимости от количества и типов образцов, модели секвенатора могут быть использованы
Секвенирование готовой библиотеки
Вторичная амплификация и очистка библиотек
Лигирование адаптеров
удаление праймеров, подготовка к лигированию
Обработка Активатором
Первичная амплификация с двумя пулами праймеров
ДНК
Принцип действия метода
Баркод
Циркуляризация
Создание наношариков ДНК
+
«Б»
48
ABCplusM-Cb
Соло-тест ABC Плюс M С-Б
Комплект для циркуляризации библиотек
Сет индексов
Количество тест-единиц
Каталожный номер
Вариант исполнения
+
«А»
48
ABCplusM-Ca
Соло-тест ABC Плюс M С-А
Сет индексов
Количество тест-единиц
Каталожный номер
Вариант исполнения
«Б»
48
ABCplusM-b
Соло-тест АВС Плюс М Б
Сет индексов
Количество тест-единиц
Каталожный номер
Вариант исполнения
*
«Б»
48
ABCplusM-Cb
HELICON® АВС Плюс С-Б
*
«А»
48
ABCplusM-Ca
HELICON® АВС Плюс С-А
«Б»
48
ABCplusM-b
HELICON® АВС Плюс Б
«А»
48
ABCplusM-a
HELICON® АВС Плюс А
Комплект для циркуляризации библиотек
Сет индексов
Количество тест-единиц
Каталожный номер
Вариант исполнения
Информация для заказа
Секвенатор генетический HELICON — товарный знак ООО «Компания ХЕЛИКОН». Для проведения исследований может быть использовано необходимое оборудование, отличное от изображённого, в соответствии с регуляторными требованиями и требованиями Руководства пользователя.
ПЦР-бокс
Центрифуга мини-вортекс
Дозаторы пипеточные
от 1 нг/мкл
Флуориметр для измерения
концентрации ДНК
Термоциклер
Секвенатор генетический HELICON
Необходимое оборудование
FAQ
Минимальное количество ДНК, выделенной из FFPE-блоков и цельной крови, необходимое для работы с набором, — 12 нг (6 мкл ДНК с концентрацией 2 нг/мкл). Минимальное количество сцДНК — 6 нг (6 мкл ДНК с концентрацией 1 нг/мкл).
Для подготовки библиотек к секвенированию ДНК и проведению секвенирования библиотек на секвенаторе HELICON® G50/G400 понадобятся соответствующие комплекты из состава наборов «Набор реагентов MGI G50 для высокопроизводительного секвенирования, в вариантах исполнения» или «Набор реагентов MGI G400 для высокопроизводительного секвенирования, в вариантах исполнения».
Также потребуются такие общелабораторные расходники, как пластик, вода деионизованная бидистиллированная и этиловый спирт. В лаборатории должны быть: ПЦР-бокс, дозаторы пипеточные, термоциклер, магнитный штатив, вортекс, центрифуга, флуориметр с совместимыми наборами, секвенатор HELICON® G50/G400.
Также потребуются такие общелабораторные расходники, как пластик, вода деионизованная бидистиллированная и этиловый спирт. В лаборатории должны быть: ПЦР-бокс, дозаторы пипеточные, термоциклер, магнитный штатив, вортекс, центрифуга, флуориметр с совместимыми наборами, секвенатор HELICON® G50/G400.
Набор можно использовать для анализа ДНК, выделенной из цельной крови, плазмы крови или парафиновых блоков (FFPE).
- Для цельной крови: кровь собрана в пробирки с ЭДТА
- Для плазмы: кровь должна быть собрана в специализированные пробирки для венозной крови с целью анализа внеклеточной ДНК
- Фиксированные образцы ткани должны обрабатываться нейтральным забуференным формалином. Не допускать избыточной фиксации — это может вызвать деградацию ДНК и появление артефактов последовательности!
- Для анализа соматических мутаций важно, чтобы содержание опухолевых клеток было не менее 20%.
Рекомендованная глубина покрытия составляет не менее 5000х при анализе ДНК, выделенной из цельной крови, плазмы и FFPE-блоков.
В одном цикле секвенирования может быть объединено до 96 уникальных образцов, включая контроли.
В одном цикле секвенирования может быть объединено до 96 уникальных образцов, включая контроли.
Да. При заказе первого набора наши специалисты проведут обучение по работе с протоколом пробоподготовки в вашей лаборатории. Кроме того, вы всегда можете обратиться к нам с любыми вопросами по работе набора solo-test@oncoatlas.ru.
Обработку данных можно осуществлять с помощью ПО Solo AVES, входящего в состав набора.
Да, если комбинации индексов не дублируются.
Получить консультацию
Заполните поля и мы свяжемся с вами
Отправляя форму, вы соглашаетесь с Политикой конфиденциальности
Материалы для пользователей
Рак молочной железы
Статус мутаций в генах BRCA1 и BRCA2 для HER2- опухолей важен для назначения PARP-ингибиторов. Статус мутации PIK3CA для HER2- HR+ опухолей важен для назначения алпелисиба. Пациентам с наследственным анамнезом при отрицательном результате ПЦР должен быть выполнен NGS-тест.
Цельная кровь
Для цельной крови необходимо соблюдать следующие требования: взятие крови проводится в пластиковые пробирки объёмом 2,5 мл с добавленной в качестве антикоагулянта динатриевой соли этилендиаминтетраацетата (ЭДТА) в конечной концентрации 2 мг/мл. Для перемешивания содержимого пробирку переворачивают 2−3 раза. В качестве антикоагулянта допускается также использование цитрата натрия.
Не допускается использование гепарина в качестве антикоагулянта.
Не допускается использование гепарина в качестве антикоагулянта.
Плазма крови («жидкостная биопсия»)
Для выделения ДНК из плазмы крови пациента следует соблюдать следующие правила: взятие крови, обычно 8 мл, проводится в специализированные пробирки, предназначенные для сбора, транспортировки и хранения образца венозной крови с целью анализа внеклеточной ДНК. Для перемешивания содержимого с антикоагулянтом и стабилизатором пробирку следует аккуратно перевернуть 8−10 раза. Пробирку с кровью следует хранить согласно инструкции производителя в темном месте при комнатной температуре.
Центрифугирование пробирки крови и отбор плазмы выполняется в лаборатории непосредственно перед выделением ДНК. На первом этапе центрифугирование проводят в пробирках с образцами крови в течение 15 минут на скорости 1900g при 4 °C. Не задевая осадка супернатант аккуратно переносят в чистые пробирки, затем еще раз центрифугируют 10 минут на 16000g при 4 °C. Супернатант переносят в чистые пробирки. Далее следует переходить к выделению ДНК или заморозить и хранить супернатант при -20°C или -80°C до момента выделения.
Центрифугирование пробирки крови и отбор плазмы выполняется в лаборатории непосредственно перед выделением ДНК. На первом этапе центрифугирование проводят в пробирках с образцами крови в течение 15 минут на скорости 1900g при 4 °C. Не задевая осадка супернатант аккуратно переносят в чистые пробирки, затем еще раз центрифугируют 10 минут на 16000g при 4 °C. Супернатант переносят в чистые пробирки. Далее следует переходить к выделению ДНК или заморозить и хранить супернатант при -20°C или -80°C до момента выделения.
Опухолевая ткань, фиксированная в формалине и заключённая в парафиновые блоки (FFPE)
Для парафиновых блоков (FFPE) необходимо соблюдать следующие требования: предварительно провести их морфологический анализ. Рекомендовано использовать образцы, в которых ткань опухоли занимает не менее 80% площади препарата, допустимое минимальное количество опухоли — не менее 20% площади препарата. В случае невыполнения данного условия рекомендуется подготовить гистологический препарат биоматериала и по результатам гистологического исследования провести разметку препарата с обратной стороны предметного стекла, отметив границы зоны опухоли.
В дальнейшем для выделения ДНК необходимо использовать отмеченную область препарата, содержащую опухолевую ткань. Для проведения исследования рекомендуется использовать фрагмент парафинового блока, соответствующий следующим параметрам: толщина каждого среза от 5 до 6 мкм; суммарная площадь фрагментов фиксированной ткани и комплексов клеток человека от 2 см². Хранить и транспортировать материал в парафиновых блоках (FFPE) необходимо при температуре от +5 до +40 °C с соблюдением мер, предотвращающих контаминацию образцов чужеродной ДНК.
В дальнейшем для выделения ДНК необходимо использовать отмеченную область препарата, содержащую опухолевую ткань. Для проведения исследования рекомендуется использовать фрагмент парафинового блока, соответствующий следующим параметрам: толщина каждого среза от 5 до 6 мкм; суммарная площадь фрагментов фиксированной ткани и комплексов клеток человека от 2 см². Хранить и транспортировать материал в парафиновых блоках (FFPE) необходимо при температуре от +5 до +40 °C с соблюдением мер, предотвращающих контаминацию образцов чужеродной ДНК.