данный маркер доступен для исследования только в научных целях
*
TPMT1*
FOXL2*
CTNNB1*
TP53*
PTEN*
PIK3CA*
DPYD*
UGT1A1*
ERBB2*
PDGFRA
KIT
NRAS
KRAS
EGFR
BRAF
набор реагентов для одновременного выявления генетических вариантов методом высокопроизводительного секвенирования (NGS) в целевых регионах генов

Соло-тест Атлас

IVD
Совместим с Illumina

Опухоли невыявленной первичной локализации

Рак желчевыводящих путей

Меланома кожи

Рак лёгкого

Рак ободочной кишки

Рак прямой кишки

Клиническое значение

Для ранней диагностики рецидива или мониторинга прогрессирования заболевания

2

Позволяет изучить спектр мутаций в опухоли и метастазах, когда гистологический материал недоступен

1

Для чего это нужно

Показана возможность эффективной работы со свободно циркулирующейв плазме ДНК для образцов опухолей легкого (минимальная концентрация ДНК 7 нг/мкл, доля мутантного аллеля от 0,1%)

4

Возможность объединения в одном запуске секвенирования с образцами, подготовленными с помощью других наборов Соло-тест

3

Уникальное решение для исследования фармакогенетических маркеров — DPYD, UGT1A1

2

Одновременное исследование BRAF, NRAS
и KIT (c-KIT) — эффективное решение
для пациентов с меланомой кожи

1

Единое решение для выявления соматических вариантов

Опухолевая ткань, фиксированная в формалине и заключённая в парафиновые блоки (FFPE)

Тип биоматериала

Минимальное покрытие для одного образца. При анализе соматических мутаций в одном запуске можно объединить до 96 образцов.
350х
Набор предназначен для совместного использования с Генетическим секвенатором MiSeq (Illumina, Inc) с набором реагентов MiSeq Reagent kit v2 300 cycles.

Параметры секвенирования

Секвенирование готовой библиотеки
Очистка продуктов амплификации, пулирование библиотек
Вторичная амплификация с Олигонуклеотидными индексами
Лигирование ЛС адаптеров
удаление праймеров, подготовка к лигированию
Обработка Активатором
Первичная амплификация с двумя пулами праймеров
ДНК

Принцип действия метода

Рекомендованное количество ДНК
30 нг
Картирование на целевые участки ДНК
>95%
Равномерность покрытия
>80%
Специфичность
>99%
Чувствительность
>95%

Диагностические характеристики

«Б»
48
ABCplus-48Ci- B
Соло-тест ABC плюс С-Б

Сет индексов

Количество тест-единиц

Каталожный номер

Вариант исполнения

«А»
48
ABCplus-48Ci-A
Соло-тест ABC плюс С-А

Сет индексов

Количество тест-единиц

Каталожный номер

Вариант исполнения

+

Комплекты для секвенирования

Комплекты для секвенирования включают в себя:
  • Комплект для подготовки образца к секвенированию,
  • Комплект для секвенирования (MiSeq Reagent Kit v2 (300-cycles), Illumina, Inc.)
«Б»
48
ABCplus-48i-B
Соло-тест АВС плюс Б

Сет индексов

Количество тест-единиц

Каталожный номер

Вариант исполнения

+
*
«Б»
48
ATLAS-48i-b
Соло-тест Атлас 48-б
*
«А»
48
ATLAS-48i-a
Соло-тест Атлас 48-а
«Б»
48
ATLAS-48Ci-b
Соло-тест Атлас 48С-б
«А»
48
ATLAS-48Ci-a
Соло-тест Атлас 48С-а

Комплекты для секвенирования

Комплекты для секвенирования включают в себя:
  • Комплект для подготовки образца к секвенированию,
  • Комплект для секвенирования (MiSeq Reagent Kit v2 (300-cycles), Illumina, Inc.)

Сет индексов

Количество тест-единиц

Каталожный номер

Вариант исполнения

Информация для заказа

MiSeq, MiSeq Dx — зарегистрированный товарный знак Illumina, Inc. Для проведения исследований может быть использовано необходимое оборудование, отличное от изображённого, в соответствии с регуляторными требованиями и требованиями Руководства пользователя к данному медицинскому изделию.

ПЦР-бокс

Центрифуга мини-вортекс

Дозаторы пипеточные

Флуориметр для измерения
концентрации ДНК

Термоциклер

Генетический секвенатор MiSeq

Необходимое оборудование

FAQ

Минимальное количество ДНК, необходимое для работы с набором, — 12 нг (6 мкл ДНК с концентрацией 2 нг/мкл).

Оптимальное количество ДНК для получения библиотек с помощью набора Соло-тест Атлас — 30 нг (6 мкл ДНК с концентрацией не менее 5 нг/мкл).